Advancements in Laser Doppler Holography for Retinal Blood Flow Imaging Zosia Bratasz (ESPCI Paris - PSL, France) mercredi 02 octobre 2024, 14:00, ESPCI, Amphi Boreau, 10 rue Vauquelin, 75005 Paris.
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Approche matricielle de la propagation des ultrasons dans les suspensions granulaires Arthur Le Ber (ESPCI Paris - PSL, France) vendredi 24 mai 2024, 10:00, Amphi IPGP, 1 rue Jussieu, 75005 PARIS
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Imagerie matricielle spatio-temporelle : de la sismologie passive des volcans à l’échographie transcrânienne du cerveau Elsa Giraudat (ESPCI Paris - PSL, France) mercredi 22 mai 2024, 14:00, Amphi IPGP, 1 rue Jussieu, 75005 PARIS
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Design and implementation of adaptive optics Full-Field Optical Coherence Tomography for in-vivo retinal imaging Yao Cai (ESPCI Paris - PSL, France) vendredi 22 décembre 2023, 14:00, Amphi IPGP, 1 rue Jussieu, 75005 PARIS
Résumé: Retina as a window to the brain, it’s directly connected to the central nervous system (CNS), transmitting neural signal triggered by the photoreceptors to the brain. In the context of neurodegenerative diseases such as Alzheimer's Disease (AD), where curative treatments are currently unavailable, and detection often occurs at late stages. Magnetic resonance imaging is primarily employed for brain examination, but it fails to attain cellular resolution, necessitates long procedures and significant costs. Thanks to the link between the retina and brain, in-vivo retina imaging is promising to give some signs of the CNS disease at the early stage, and in-vivo retinal imaging can be assessed with high-resolution cellular imaging.The presence of 3D eye motion and ocular aberrations are two main challenges for in-vivo retinal imaging. The technique of time-domain full-field optical coherence tomography (TD FFOCT) has demonstrated 3D high resolution with low system complexity. One key advantage of TD FFOCT is that the lateral resolution is nearly twice of the standard imaging system, and it is more robust to the low-order symmetric aberrations, such as defocus and astigmatisms, which account for approximately 92% of wavefront error in ocular aberrations. Nevertheless, TD FFOCT exhibits relatively low detection sensitivity, posing challenges for imaging inner retinal layers and imaging a diverse population with eye diseases.My PhD research focuses on the design and implementation of advanced TD FFOCT systems in combination with adaptive optics for enhanced detection sensitivity in in-vivo retinal imaging, especially the visualizations of inner retina features with low reflectivity.
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Microscopie de Fluorescence par illumination structurée à démodulation rapide Pierre Bourdoncle (ESPCI Paris - PSL, France) lundi 11 décembre 2023, 14:00, Amphi IPGP, 1 rue Jussieu, 75005 PARIS
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Guided elastic waves in soft media Alexandre Delory (ESPCI Paris - PSL, France) mercredi 29 novembre 2023, 14:00, Amphithéatre Astier, bâtiment Esclangon, campus Jussieu
Résumé: This PhD thesis explores guided elastic waves in soft materials, particularly synthetic elastomers like Ecoflex that mimic human tissue properties. It aims to understand the impact of prestress on guided waves and their broader implications in physiological processes. The thesis covers mechanics, elastic wave velocities, and dispersion diagrams in soft plates and strips. Material rheology is addressed through a semi-analytical method, aligning theoretical predictions with experimental findings. The acoustoelastic effect and viscoelasticity are combined to quantify the induced anisotropy in a highly-stretched plate and the dispersion curves of in-plane guided waves in prestressed strips. The application of shear wave elastography is explored to improve medical imaging, especially for elongated tissues. The thesis further establishes connections between soft materials and biological tissues by examining the vibrations of the basilar membrane in the cochlea. Modeling this membrane as a thin strip, this thesis explains the frequency discrimination by evaluating the local dispersion along the strip. In the last chapter, a space-time interface is created by applying an increasing axial stress, leading to frequency and wavenumber changes for the flexural wave that crosses it. This research has applications in wave manipulation. In summary, this PhD thesis delves into guided elastic wave propagation in soft materials, covering theory, experiments, and practical applications in diverse fields such as medical imaging and biology.
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Détection de front d'onde dans l'infrarouge à l'aide de diffuseurs minces Anwesh Bhattacharya (ESPCI Paris - PSL, France) mardi 11 juillet 2023, 14:00, Amphithéatre Charpak, campus Jussieu
Résumé: Les caméras actuellement utilisées dans l’infrarouge (IR) ne mesurent que l'amplitude du rayonnement. Or, la phase est utile et complémentaire à l’amplitude pour comprendre les propriétés de l'objet imagé, telles que les variations de l'indice de réfraction. Nous avons mis au point une nouvelle technique d'imagerie de la phase utilisant le rayonnement IR à ondes longues (LWIR) (7-14 µm), en utilisant un matériau diffusant mince et une caméra microbolométrique non refroidie. La lumière diffusée par le matériau crée des motifs complexes de tavelures ou "speckle", dont l'analyse donne accès à la phase du rayonnement IR. Nous avons testé notre technique sur des lentilles et des objets fabriqués présentant des propriétés de phase complexes, et réussi à reconstruire leurs fronts d'onde (profils de phase). Cela offre de nouvelles possibilités pour analyser l'émission IR, mais aussi visualiser des matériaux non transparents, comme les tranches de semi-conducteurs, à l'aide du rayonnement LWIR.
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Analyse multi-dimensionnelle de la matrice de réflexion pour l'imagerie ultrasonore quantitative Flavien BUREAU (ESPCI Paris - PSL, France) lundi 03 juillet 2023, 14:00, Amphitheatre Boreau, ESPCI
Résumé: L’échographie est une technique d’imagerie très utilisée en médecine, notamment car elle est non invasive. Elle consiste à insonifier un milieu avec une onde ultrasonore et à enregistrer les échos rétrodiffusés par les hétérogénéités du milieu au moyen d’une sonde ultrasonore. En appliquant des retards temporels appropriés à chaque canal d’émission et de réception, il est possible d’obtenir une image de la réflectivité du milieu. Cette approche repose sur des hypothèses fortes que sont une vitesse du son constante et un régime de diffusion simple. En pratique, ces hypothèses sont loin d’être vérifiées. En effet, les variations spatiales de la vitesse du son en tout point du champ de vision déforment le front d’onde, ce qui impacte considérablement le processus de focalisation et donc la résolution de l’image. Dans ce travail, ces limites fondamentales sont étudiées et résolues en enregistrant la matrice de réflexion du milieu, qui contient toute l’information disponible sur le milieu étudié. Alors que la génération d’une image ultrasonore est basée sur un processus de focalisation simultanée en entrée et en sortie sur chaque point de l’image, l’imagerie matricielle consiste à découpler les points focaux d’entrée et de sortie afin de pouvoir examiner les aberrations et la diffusion multiple en tout point. Plus précisément, l’objectif de cette étude est d’exploiter tous les degrés de liberté disponibles dans cette matrice pour étendre l’imagerie matricielle ultrasonore à plusieurs dimensions : (i) dans le domaine spatial en passant de l’imagerie 2D à l’imagerie 3D avec des applications à l’imagerie transcrânienne; (ii) en exploitant les degrés de liberté temporels pour caractériser la réponse spectrale d’objets résonants tel que les microbulles ; (iii) réaliser un autoportrait du processus de focalisation de l’onde en tout point du milieu ; (iv) exploiter la sensibilité du déphasage de Gouy au niveau du plan de focalisation pour sonder la défocalisation et compenser les aberrations axiales ; (v) cartographier la vitesse du son pour obtenir une image quantitative des tissus biologiques.
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Imagerie à super-résolution plein champ basée sur un signal de
fluorescence modulé dans le temps Maximilian LENGAUER (ESPCI Paris - PSL, France) mardi 13 juin 2023, 14:00, Amphitheatre IPGP
Résumé: La microscopie à fluorescence est devenue le principal outil d'imagerie
dans la recherche biologique. En raison de sa capacité à imager
spécifiquement la structure biologique d'intérêt dans les cellules
vivantes, la technique est inestimable pour de nombreuses tâches, en
particulier en biologie cellulaire et moléculaire. L'invention de la
microscopie à fluorescence à super-résolution il y a environ 20 ans permet
maintenant la localisation de molécules uniques dans l'échantillon bien en
dessous de la limite de diffraction, qui a longtemps été considérée comme
une restriction absolue et insurmontable de la microscopie optique. Ces
dernières années, des nouvelles techniques ont été introduites dans le
domaine en utilisant des motifs d'éclairage structurés, atteignant ainsi
des précisions de localisation nettement inférieures à 5 nm. Dans ce
travail, nous présentons une nouvelle méthode de microscopie de
fluorescence super-résolue utilisant un éclairage structuré modulé dans le
temps, qui permet de déterminer les positions des émetteurs dans
l'échantillon uniquement en fonction du nombre de photons émis dans le
temps. Il est important de noter que la procédure de localisation ne
dépend donc pas d'une caméra en tant que dispositif d'acquisition, mais ne
nécessite qu'un seul module de comptage de photons. En même temps, la
technique maintient une capacité d'imagerie à plein champ. Cela se traduit
par une résolution temporelle nettement plus élevée par rapport aux
techniques basées sur la caméra, tandis qu'une résolution spatiale
comparable est obtenue. Cette nouvelle méthode a reçu le nom de TimeLoc,
abréviation de 'Time-modulation Localization'. Après la mise en œuvre
expérimentale, la fonctionnalité de la technique a d'abord été évaluée sur
des billes fluorescentes en tant que qu'objet de calibration brillants,
donnant des signaux d'émission avec un nombre de photons importants et
facilement modulable . Les résultats expérimentaux ont ainsi montré que la
mise en œuvre donnée atteint la limite de résolution théorique de la
technique. Plus récemment, des expériences ont été menées sur des
échantillons biologiques, où la reconstruction d'image du réseau de
microtubules dans les cellules COS7 a été réalisée, démontrant ainsi la
détection flurophores individuelles emettant en régime de molécules
uniques. Une perspective prometteuse pour TimeLoc est de le combiner avec
des approches résolues en temps (Fluorescence Lifetime Imaging (FLIM)),
qui fournit des informations sur le microenvironnement chimique dans
l'échantillon. Étant donné que FLIM nécessite un dispositif de détection
rapide, TimeLoc serait particulièrement bien adapté pour détecter
simultanément les positions des émetteurs dans l'échantillon.
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Matrice de transmission acousto-élastique et analyse modale sans contact : application à des structures aéronautiques Chloë PALERM (ESPCI Paris - PSL, France) jeudi 06 avril 2023, 14:00, Amphitheatre IPGP
Résumé: Dans les moteurs d'aéronefs, dont la fiabilité est un enjeu majeur, il
est indispensable de caractériser les modes propres de vibration des
pièces afin d’anticiper les phénomènes de fatigue ou encore de détecter
l’apparition d’endommagements. Dans ce manuscrit, nous proposons une
méthode d’analyse modale par excitation acoustique. Les pièces testées
sont mises en vibration par un réseau de haut-parleurs et les
déplacements sont mesurés à l’aide d’un vibromètre laser. La matrice de
transmission acousto-élastique ainsi mesurée permet de s'affranchir de
tout artefact dû au contact. Nous l'exploitons ensuite pour étudier la
structure modale de pièces à symétries de rotation continues ou
discrètes, saines ou endommagées. En effet, sa décomposition en valeurs
singulières (SVD) permet d'identifier des modes superposés, favorisés
par ce type de géométrie. Le lien entre la SVD, les modes propres de la
structure et leur couplage acousto-élastique est établi. Cette approche
est validée sur une plaque carrée en aluminium libre puis partiellement
encastrée. Nous l’appliquons ensuite à quatre pièces saines de
turbomoteurs : un pignon, un pignon évidé et deux compresseurs. Des
simulations aux éléments finis sont réalisées de manière à en comprendre
le couplage acousto-élastique. Puis, les matrices de transmission sont
mesurées et leur SVD met en évidence les distributions modales bien
distinctes pour ces différentes géométries, que nous analysons. Le
comportement modal de ces pièces change lorsqu'un endommagement brise
leur symétrie. Nous observons numériquement et expérimentalement que sur
un pignon, une modification locale de masse ou de raideur se traduit
principalement par une variation de la fréquence de résonance des modes.
Ces résultats sont corroborés par une approche perturbative de
l’endommagement. Cette approximation n’est plus valable dans le cas d'un
compresseur dont certaines pales sont déformées. Un classement des modes
fondé sur une description phénoménologique est proposé. Pour terminer,
les vecteurs singuliers de la matrice de transmission et le réseau de
haut-parleurs sont utilisés de manière à contrôler le champ vibratoire
dans le cas de modes superposés.
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Contrôle spatiotemporel de front d'onde pour la super-résolution Guillaume NOETINGER (ESPCI Paris - PSL, France) mardi 21 mars 2023, 14:30, Amphitheatre IPGP
Résumé: Le microscope optique est un outil de base des scientifiques. D’après le modèle ondulatoire de la lumière, sa résolution est limitée à quelques centaines de nanomètres, c’est la limite de diffraction. Des méthodes basées sur l’utilisation de molécules fluorescentes ont repoussé cette limite à quelques nanomètres. Il serait d’une grande utilité de pouvoir dépasser cette limite sans avoir recours à ces composés parfois toxiques.
L’image formée par un microscope dépend du microscope mais aussi de l’éclairage de l’objet observé. Dans cette thèse, nous éclairons l’objet par un émetteur en rotation autour d’un axe au lieu d’une illumination statique habituellement. Un objet sur l’axe de rotation ne verra pas le mouvement de l’émetteur car la distance les séparant ne varie pas, un objet hors axe percevra une variation de l’onde émise puisque l’émetteur s’éloigne et se rapproche périodiquement. En utilisant ce critère on distingue des objets plus petits que la limite de diffraction.
La viabilité de cette approche est démontrée à l'aide d'expériences en acoustique audible. Enfin, son implémentation sur un microscope confocal permet de véritablement observer des objets habituellement indiscernables avec cet outil.
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Nouvelles stratégies de multiplexage et d'imagerie de la durée de vie de la fluorescence en microscopie de localisation de molécules uniques Surabhi K. Sreenivas (ESPCI Paris - PSL, France) mardi 24 janvier 2023, 14:00, Zoom
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